日本室町時代中葉當權的幕府威信銳減野心勃勃的醍醐景光（中井貴一飾）為了成就霸業而將尚未出生的兒子百鬼丸獻祭給48個魔神他和妖怪定下約定取走了包括眼、耳、口、鼻等在內的48個器官 　　一出生就缺少器官部位的百鬼丸被拋入河中後來為醫生養父（原田芳雄飾）所救替他製作了義眼、義肢等補足了身上缺失並命名為百鬼丸（妻夫木聰飾）撫養他長大為了擺脫自己被詛咒的命運奪回身體的每一個部分百鬼丸向占有自己器官的48個魔神宣戰離家踏上征戰之旅 　　在尋找魔神的旅途上百鬼丸遇到了自稱“俠盜”的多羅羅（柴崎幸飾）為了得到百鬼丸手中的寶劍多羅羅跟隨他一起踏上旅程