日暮戈薇是就讀於國中三年級的15歲普通小女生某日她偶然通過家中神社的枯井來到了500年前的戰國時代時狼煙四起妖怪橫行世間大地生靈塗炭戈薇在禦神木那裏邂逅了被封印的半妖犬夜叉50年前意欲變成真正妖怪的犬夜叉為了得到四魂之玉結識擁有強大靈力的巫女桔梗經過一段時間相處兩人之間產生了感情犬夜叉因此希望變成人類而桔梗也打算在淨化完四魂之玉後過回普通人的生活然而對桔梗心存邪念的盜賊鬼蜘蛛將靈魂和肉體獻給妖怪繼而轉生變成邪惡的半妖奈落在他的一番挑撥下犬夜叉被桔梗封印在神木之上重傷的桔梗也在悲傷絕望中死去 　　桔梗轉生的戈薇解救了犬夜叉卻不慎將四魂之玉射成碎片為了找回碎片她和犬夜叉以及隨後遇到的夥伴：七寶、彌勒、珊瑚踏上了充滿艱難險阻的旅途……